Istituita allo scopo di decongestionare l'Ateneo "Federico II", la costituzione dell'Ateneo venne prevista dal il DPCM 12 maggio 1989, che ne programmava l'istituzione nell'ambito del piano di sviluppo quadriennale delle università 1986-1990.L'ateneo è articolato in varie sedi, dislocate prevalentemente in Caserta e nella relativa provincia. Data la collocazione, la maggior parte delle attività didattiche di cinque facoltà (compresa quella situata nella frazione di San Leucio) si svolge a Caserta e in provincia. L'origine storica delle sedi delle Facoltà, tutte pienamente ristrutturate, rende l'Ateneo uno dei migliori in termini di strutture. Il rettorato ha due sedi: una a Caserta, presso la Reggia ed una a Napoli, in via Costantinopoli al civico 104, nei pressi del vecchio policlinico, che è stato il nucleo fondante dell'ateneo (nato infatti per scorporo di una delle due Facoltà di medicina e chirurgia dell'università federiciana).